作为中国基因行业的引领者和奠基者,华大基因一直以高标准、严要求创新发展。3月29日,华大基因唐冲博士团队于基因组学顶级期刊Genome Biology发表重要科学论文“BIND&MODIFY:a long-range method for single-molecule mapping of chromatin modifications in eukaryotes”。
在唐冲博士团队发表的论文中着重提到了华大基因再次推出的升级版的蛋白-DNA交互作用技术。华大基因蛋白-DNA交互作用技术通过对不打断的大片段DNA分子进行特异性甲基化标记,利用长读长测序,获得高精度、DNA单分子水平上的组蛋白修饰、DNA结合蛋白序列信息,同时获得DNA单分子异质性、CpG甲基化多组学、复杂结构域的蛋白-DNA互作等信息。该结果一经发布就受到了业内人士的高度关注。
华大基因瓮喆博士介绍道,该方法(BIND&MODIFY)首先构建了一种葡萄球菌蛋白A-甲基转移酶融合蛋白(pA-M.EcoGLL),将针对蛋白修饰、DNA结合蛋白特定抗体与细胞孵愈后,pA-M.EcoGLL与特异性抗体结合。
华大基因瓮喆博士
随后,激活甲基转移酶活性,将抗体结合蛋白附近的DNA序列中的腺嘌呤(adenine)高效率转化为N6-methyladenosine(m6A),最后,通过纳米孔单分子长读长测序对m6A位点进行检测,获得单分子水平的高精度蛋白-DNA结合位点信息。简而言之,本方法(BIND&MODIFY)是一种具有普适性、高质量、高精度的单分子水平上实现蛋白-DNA交互作用检测的方法,该技术能够在单分子水平上为解析细胞命运决定与功能异质性的表观遗传学调控机制提供了一种强有力的工具。
在测序成本不断降低的时代,本方法能够在长读长测序领域为广大研究者提供了一种新型研究方法与方式,系统实现了蛋白-DNA交互作用信息与多组学信息的综合分析。目前,华大基因唐冲博士团队正在对BIND&MODIFY技术进行优化,针对更多与人类疾病相关的蛋白-DNA交互作用进行系统分析,为后续新型药物靶点发现提供基础。
文章发表于Genome Biology
未来,华大基因也会继续凭借他们本身的技术优势以及平台优势,持续引领新技术、拓展新领域、探索新模式、创造新业绩,全力以赴践行初心和使命。
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